Masalah utama di budidaya Apel Kota Batu adalah penurunan mutu lahan, harga buah apel yang tidak menentu dan akses permodalan bagi petani kecil masih sulit, serta peran kelembagaan petani belum maksimal. Suhariyono yang pernah belajar ilmu tanaman atau Crop Science di Wageningen Belanda ini mengatakan: ,”revitalisasi apel Kota Batu perlu untuk menjadikan apel Batu kembali  menjadi ikon Kota Batu lagi, yang kini luas kebunnya sedang menurun,”katanya. Penetapan harga pokok apel di tingkat petani harus diupayakan, pemerintah. Menurutnya dalam menetapkan harga pembelian terendah oleh pedagang harus mengacu pada harga pokok yang dikeluarkan oleh petani untuk menghasilkan buah tersebut. “Nilai harga pembelian oleh pedagang minimal harus setara dengan harga pokok, tetapi sebaiknya…